最新公告:
TEl:400-123-4657
联系必威 详细
电话:
400-123-4657
邮箱:
lyyxzg@admin.com
地址:
广东省广州市天河区88号
培育技术
当前位置: 必威 > 培育技术

必威betway官网下载辰山植物园科研人员首次利用组学变异鉴定蕨类植物中的双向不对称杂交

发布时间:2024-08-17 点击量:841

  必威betway官网下载由于缺乏有效的生殖隔离机制,蕨类植物更容易发生自然杂交。这导致了蕨类植物中杂交种的比例较高,例如在日本超过三分之一的蕨类植物是杂交种。因此,识别蕨类植物中的杂交种对于理解其多样性尤为重要。然而,在某些地区,蕨类植物杂交种的研究还不充分。例如,在中国已知的2254种蕨类植物中,只有62种被明确鉴定为杂交种,表明我们对杂交种的识别和了解还有很大的不足。

  近年来,利用叶绿体和核基因片段鉴定了许多蕨类植物的杂交起源。此外,随着高通量测序的发展,简化基因组测序或重测序技术也被用于研究物种网状进化及杂交或基因流。

  鳞盖蕨属所隶属的碗蕨科是水龙骨目的五大支系之一。该科由11个小属组成,其中只有3个属的物种数超过50种,包括鳞盖蕨属(另两个是姬蕨属和大碗蕨属)。鳞盖蕨属不仅具有较高的物种多样性,而且在形态上也非常丰富。比如,叶片从二回到五回不等,具有六种叶表皮及气孔特征,孢子纹饰多样,染色体基数变化较大。杂交可能是导致鳞盖蕨属多样性如此高的原因之一,许多基于形态学或少量叶绿体片段的研究推测鳞盖蕨属包含许多杂交种,但都无法最终证明。

  图1 本研究的杂交种岭南鳞盖蕨(CD)必威betway官网下载、及其父母本物种华南鳞盖蕨(AB)、光叶鳞盖蕨(EF)(韦宏金摄)

  辰山蕨类课题组的研究人员选取岭南鳞盖蕨作为典型,探讨杂交对鳞盖蕨属物种多样性的促进作用。本研究对岭南鳞盖蕨及其潜在亲本进行了双酶切简化基因组测序,提取了核和叶绿体的SNP位点。

  首先,采用核SNP构建系统发生树、主成分分析和群体结构分析等聚类分析解析其遗传构成。

  图2 杂交种及其父母本的系统发生(A)、主成分分析(B)和遗传构成(C)

  随后,为了确认观察到的遗传混合模式是否由杂交产生,我们利用D-suite程序中的ABBA-BABA统计值和Treemix软件中的基因频率协方差来检测基因流。最后,利用叶绿体SNP位点构建系统发育树必威betway官网下载,追踪母体起源。

  对核SNP位点的聚类分析表明,岭南鳞盖蕨具有由华南鳞盖蕨和光叶鳞盖蕨组合的遗传组成。此外,正如两种不同基因流分析所表明的那样,该分析提供了从亲本物种到杂交种的重要基因流特征的有力证据。此外,在叶绿体系统树上,不同的岭南鳞盖蕨样品分别与华南鳞盖蕨或光叶鳞盖蕨聚集在一起,表明其不同的母本来源。然而,两种母本比例显著偏离1:1,表明岭南鳞盖蕨是华南鳞盖蕨和光叶鳞盖蕨的双向不对称杂交后代。

  本研究首次利用基因组水平的变异位点,不仅检测到了蕨类植物中杂交物种的混合遗传组分,更重要的是明确检测到了基因流,并证明了双向不对称杂交基因流,从而非常明确地证明了岭南鳞盖蕨的杂交起源,大大提高了我们对杂交在蕨类植物物种多样性中的作用的认识。

  该研究以“Genome-wide data reveal bi-direction and asymmetrical hybridization origin of a fern species Microlepia matthewii”为题,于2024年7月在线发表于Frontiers in Plant Science。文章链接:https辰山已毕业研究生罗俊杰和科研助理商辉博士为本文的共同第一作者,深圳兰科植物保护研究中心严岳鸿研究员和上海辰山植物园蕨类分子生态与功能演化课题组青年课题组长沈慧博士为本文的共同通讯作者,辰山科研助理薛志青博士、已毕业研究生王莹、上海师范大学戴锡玲副教授也参与了本研究。研究得到了国家自然科学基金和上海市绿化和市容管理局辰山专项的资助。同时感谢国家重要野生植物种质资源库辰山中心对本研究的支持。

  ●半价优惠:6周岁(不含6周岁)—18周岁(含18周岁)未成年人、全日制大学本科及以下学历学生,须本人凭学生证或有效证件购票于当日经专用通道检票入园。

  ●8.5折优惠:60周岁(含60周岁)—64周岁老年人凭本人相关有效证件可享受。

  ●免票:65周岁(含)以上老年人、1.3米(含)以下或6周岁(含)以下儿童、现役军人、残疾军人、烈士遗属、因公牺牲军人遗属、病故军人遗属、现役军人家属(父母,配偶,子女)、残疾人士以及消防救援人员(在职、退休、残疾、政府专职消防员和消防救援院校学员)可申请免票。

  1、G60 沪昆高速公路松江新城出口沿嘉松公路向北至辰花路左转到达1号门,至沈砖公路左转到佘天昆公路左转到达2号门。

  2、G50沪渝高速公路赵巷出口左转沿嘉松公路向南至辰花路右转到达1号门,至沈砖公路右转到佘天昆公路左转到达2号门。

  园区内导览车线路有A线站,B线站。A/B线元/人,中途下车再上车需另行购票。

  辰山属于军事管控区,辰山范围内无人机受反制管理,如无申报手续私自使用无人机造成个人财产受损的将由游客自行承担,同时承担相应的法律责任。

  原标题:《辰山植物园科研人员首次利用组学变异鉴定蕨类植物中的双向不对称杂交》

  本文为澎湃号作者或机构在澎湃新闻上传并发布,仅代表该作者或机构观点,不代表澎湃新闻的观点或立场,澎湃新闻仅提供信息发布平台。申请澎湃号请用电脑访问。